Исследователи из Института биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича разработали программу, которая помогает определять, в каких участках белков ферменты выполняют расщепление. Разработка позволит ускорить исследования новых ферментов и анализ больших массивов протеомных данных.Ферменты-протеазы — это особые белки, которые разрезают другие белки на части. Они участвуют в процессах пищеварения, работе иммунной системы, развитии заболеваний и жизнедеятельности бактерий.
Чтобы понять, как именно работает тот или иной фермент, ученым важно определить, в каких участках белковой цепи он расщепляет белок. Современная масс-спектрометрия позволяет одновременно анализировать тысячи фрагментов белков, однако существующие программы в основном предназначены только для поиска и идентификации белков, а не для изучения особенностей работы ферментов.
Разработанная программа CleaveScope автоматически обрабатывает результаты масс-спектрометрического анализа, определяет места расщепления белков и показывает закономерности в виде наглядных тепловых карт и графических схем. В отличие от многих существующих инструментов, программа напрямую работает с результатами поисковых систем и не требует сложной ручной подготовки данных.
Читать материал подробнее